前言：
國內(nèi)很多牧場選擇公牛時(shí)喜歡設(shè)定每個(gè)性狀的最低限值，比如要求公牛$NM≥800，產(chǎn)奶量育種值≥1200，生產(chǎn)壽命≥4。這樣做存在很大弊端，假如A公牛$NM指數(shù)813，產(chǎn)奶量育種值1200，生產(chǎn)壽命5.0，B公牛$NM指數(shù)883，產(chǎn)奶量育種值1100，生產(chǎn)壽命7.6，難道B公牛就不能用了嗎？但令人高興的是，國內(nèi)育種理念超前的牧場已開始通過自定義指數(shù)挑選公牛，這篇文章主要介紹在制定自定義指數(shù)時(shí)存在的一些誤區(qū)。
育種指數(shù)是根據(jù)奶牛不同性狀的經(jīng)濟(jì)價(jià)值來確定奶牛總經(jīng)濟(jì)價(jià)值的方法，選擇正確的經(jīng)濟(jì)價(jià)值性狀及設(shè)定每個(gè)性狀的權(quán)重，可以最大限度地提高奶牛遺傳改良的總體經(jīng)濟(jì)價(jià)值。
如今自定義育種指數(shù)已相對容易，對于大部分育種公司來說也是一種常規(guī)服務(wù)，它允許牧場主建立一個(gè)適合牧場管理和市場需求的特定指數(shù)，更多地強(qiáng)調(diào)適合牧場需求的最重要性狀，剔除一些對牧場沒有價(jià)值的性狀。
那么，自定義指數(shù)是實(shí)現(xiàn)更快遺傳進(jìn)展和群體盈利能力的最好方法嗎？許多牧場主相信——如果選擇的性狀集中在一個(gè)或者極少數(shù)性狀上，那么牛群遺傳進(jìn)展會(huì)更快。但是，許多性狀都會(huì)影響到牧場的實(shí)際盈利能力，自定義指數(shù)可能會(huì)忽視相關(guān)性狀對遺傳價(jià)值的影響，導(dǎo)致高估或低估一些特定性狀的價(jià)值。本文主要針對自定義指數(shù)存在的錯(cuò)誤觀點(diǎn)以及可能產(chǎn)生的后果進(jìn)行說明。制定自定義指數(shù)時(shí)很容易忽略遺傳性狀之間的相關(guān)性，隨著時(shí)間的推移，這可能對群體遺傳進(jìn)展產(chǎn)生重大影響。為了說明這一點(diǎn)，在2018年8月出版的$NM修訂版中，用各個(gè)性狀之間的相關(guān)性和遺傳進(jìn)展公式創(chuàng)建了一個(gè)電子表格，當(dāng)改變某個(gè)性狀的權(quán)重時(shí)，電子表格可以預(yù)測預(yù)期的性狀遺傳進(jìn)展。假設(shè)一個(gè)牧場主要關(guān)注牛奶中的蛋白質(zhì)，自定義指數(shù)時(shí)就可以對蛋白質(zhì)設(shè)定一個(gè)相當(dāng)大的權(quán)重，只給乳脂量少許的權(quán)重；同時(shí)，這個(gè)牧場還重視奶牛的健康性狀，那么就需要集中在女兒懷孕率和生產(chǎn)壽命上。因此，這個(gè)牧場的自定義指數(shù)權(quán)重為60%的蛋白質(zhì)、10%的脂肪、20%的生產(chǎn)壽命和10%的女兒懷孕率。這個(gè)指數(shù)非常簡單，緊緊地集中在幾個(gè)最重要的性狀上面。表1顯示了自定義指數(shù)（$Cust）和$NM指數(shù)各個(gè)性狀的權(quán)重、相關(guān)性和預(yù)期遺傳進(jìn)展的比較，藍(lán)色部分為各個(gè)性狀在5年后獲得遺傳進(jìn)展的優(yōu)勢。
表1中，與$NM相比，自定義指數(shù)在乳蛋白量上將獲得更大的遺傳進(jìn)展，然而有趣的是，與$NM相比，女兒懷孕率和生產(chǎn)壽命的遺傳進(jìn)展預(yù)計(jì)會(huì)減少。請記住，自定義指數(shù)在這兩方面都有較高的權(quán)重，這是由于沒有考慮到女兒懷孕率和生產(chǎn)壽命與$NM其它性狀之間的關(guān)系。如果不選擇與女兒懷孕率和生產(chǎn)壽命相關(guān)的其它性狀，他們的預(yù)期遺傳進(jìn)展就會(huì)降低。為證明表1的預(yù)期結(jié)果，從2018年8月份開始，比較了目前在群的荷斯坦公牛，分別使用自定義指數(shù)（$Cust）和$NM指數(shù)進(jìn)行排名，對比每項(xiàng)指數(shù)前25%的公牛各個(gè)性狀的育種值；同樣，將兩家大型奶牛場經(jīng)過基因組檢測的母牛集中在一起，也分別使用自定義指數(shù)（$Cust）和$NM指數(shù)進(jìn)行排名，表2顯示出與表1相同的結(jié)果。(即使$Cust指數(shù)在PL和DPR上的權(quán)重更高，選出的公牛育種值仍然低于$NM)
為了可以進(jìn)一步了解自定義指數(shù)和$NM指數(shù)在實(shí)際牧場中表現(xiàn)，在2017年美國一家牧場對約1500只母牛進(jìn)行了回顧性分析。使用父母平均值用以計(jì)算每頭奶牛的自定義指數(shù)($Cust)和$NM指數(shù)。表3顯示了兩個(gè)指標(biāo)前25%的母牛各個(gè)性狀的實(shí)際表現(xiàn)和遺傳育種值。很有意思的是，自定義指數(shù)的群體平均產(chǎn)奶時(shí)間減少了33天。
當(dāng)對群體中所有牛群按照四等分進(jìn)行比較時(shí)，兩種選擇指數(shù)與奶牛的平均產(chǎn)奶時(shí)間產(chǎn)生了較大的差異，使用$NM指數(shù)與平均產(chǎn)奶時(shí)間的線性趨勢更加一致，這表明$NM指數(shù)對奶牛的產(chǎn)奶壽命指向性更好。（圖1）
最后，應(yīng)該謹(jǐn)慎地處理自定義指數(shù)，一個(gè)牧場可以制定一個(gè)比通用的育種指數(shù)更能滿足牧場需求的自定義指數(shù)，但是，在制定之后，要明確地了解預(yù)期結(jié)果。
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